Для выкопки крупных саженцев, выращенных в школах длительного выращивания, и деревьев в лесу должны примениться машины, позволяющие выкапывать посадочный материал с комом земли, в котором находится основная часть корней. В настоящее время процесс выкопки крупных деревьев все еще выполняется вручную ввиду отсутствия необходимых машин.

Выкопка крупномерного посадочного материала осуществляется в различное время года, в зависимости от целей и задач: весной, осенью и летом. Для зимней перевозки выкопанные с осени деревья с комом подготавливают, комья деревьев обливают водой и замораживают. В таком виде деревья с комом перевозятся без упаковки. В другое время саженцы с комом перевозятся в специальной упаковке для кома, которая чаще всего имеет вид дощатой обшивки щитами.

Ручной способ выкопки деревьев с комом прямоугольной или цилиндрической формы определенных размеров позволяет лишь частично механизировать процесс, выкопки: ком земли с деревом, окопанный со всех четырех сторон или по окружности лопатами, подрезают в основании стальным тросом с помощью тяги трактора, автомашины или лебедки. К операциям, выполняемым вручную, относятся окапывание дерева с комом и выгрузка грунта на поверхность, упаковка кома в дощатую или другую тару (в вазоны), а также некоторые вспомогательные операции. Выкопка деревьев для озеленения может производиться круглый год, но, как правило, из талого грунта, который сохраняется не промороженным с помощью утепляющих подушек вокруг стволов из листьев, опилок или торфяной крошки. Выкопка деревьев с комом из промороженного грунта требует применения пневматических отбойных молотков, что не всегда целесообразно. Кому в плане обычно придается квадратная или круглая форма. Книзу ком обычно сужается в виде усеченной пирамиды или усеченного конуса. Наибольший размер кома—диаметр 2 м, глубина 0,75 м принимается для деревьев с разветвленной корневой системой. Для деревьев с развитыми стержневыми корнями размер кома принимается меньше (диаметр 1,5—1 м, высота 0,8—0,6 м). Ниже приводятся средние показатели объема и веса кома и кома с деревом.